Coronavirus HKU15

Deltacoronavirus suis

Coronavirus HKU15

Classification Domaine |  Riboviria

|

Règne |  Orthornavirae
Embranchement |  Pisuviricota
Classe |  Pisoniviricetes
Ordre |  Nidovirales
Sous-ordre |  Cornidovirineae
Famille |  Coronaviridae
Sous-famille |  Orthocoronavirinae
Genre |  Deltacoronavirus
Sous-genre |  Buldecovirus

Espèce

Deltacoronavirus suis
ICTV, 2015[1]

Deltacoronavirus suis, aussi appelé coronavirus HKU15 ou coronavirus porcin HKU15 (en anglais : porcine coronavirus HKU15, PorCoV HKU15) voire deltacoronavirus porcin, est un coronavirus de la famille Deltacoronavirus qui infecte les porcs. Il est découvert en 2012 à Hong Kong[2]. Principalement actif l'hiver, il provoque des diarrhées et peut-être des symptômes respiratoires chez les animaux atteints.

PorCoV HKU15 est pour la première fois identifié dans des matières fécales de porcs hongkongais en 2012. Dans les années suivantes, le virus est trouvé au sein de nombreux élevages en Asie de l'Est, Asie du Sud-Est et Amérique du Nord. En 2014, PorCoV HKU15 est identifié chez des porcs atteints de diarrhée en Ohio[3] (États-Unis). Le génome complet de la souche américaine est alors publié[4]. Celle-ci est ensuite trouvée chez des cochons de ferme au Canada[5].

D'abord trouvé dans des échantillons intestinaux et des selles, il est ensuite isolé dans des prélèvements nasopharyngés. Une étude de l'université de Hong Kong publiée en 2017 montre que le virus a été découvert dans les voies respiratoires de 9,6 % des porcs étudiés (sur une population de 249 porcs), ce qui implique la possibilité d'une transmission aérienne et de symptômes respiratoires en plus des diarrhées. La majorité des prélèvement positifs avaient été collectés en hiver. L'étude montre également la présence de quasi-espèces et le fait que les échantillons asiatiques sont plus diversifiés que les échantillons américains[6].

## Voir aussi

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* Virus de la diarrhée épidémique porcine, un alphacoronavirus.

## Références

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* (en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « Coronavirus HKU15 » (voir la liste des auteurs).

1. ↑ (en) « Virus Taxonomy: 2023 Release », ICTV, août 2024 (consulté le 16 août 2024).
2. ↑ P. C. Woo, S. K. Lau, C. S. Lam, C. C. Lau, A. K. Tsang, J. H. Lau, R Bai, J. L. Teng, C. C. Tsang, M Wang, B. J. Zheng, K. H. Chan et K. Y. Yuen, « Discovery of seven novel Mammalian and avian coronaviruses in the genus deltacoronavirus supports bat coronaviruses as the gene source of alphacoronavirus and betacoronavirus and avian coronaviruses as the gene source of gammacoronavirus and deltacoronavirus », Journal of Virology, vol. 86, no 7, 2012, p. 3995–4008 (PMID 22278237, PMCID 3302495, DOI 10.1128/JVI.06540-11)
3. ↑ « Ohio Department of Agriculture finds new pig virus », Reuters, 12 février 2014 (lire en ligne, consulté le 25 avril 2014)
4. ↑ L Wang, Y Zhang et B Byrum, « Complete Genome Sequence of Porcine Coronavirus HKU15 Strain IN2847 from the United States », Genome Announcements, vol. 2, no 2, 2014, e00291–14 (PMID 24744332, PMCID 3990748, DOI 10.1128/genomeA.00291-14)
5. ↑ Ontario Pork, « Industry Advisory - Swine DeltaCoronavirus », 18 mars 2014 (consulté le 25 avril 2014)
6. ↑ (en) Patrick Cy Woo, Susanna Kp Lau, Chi-Ching Tsang, Candy Cy Lau, Po-Chun Wong, Franklin Wn Chow, Jordan Yh Fong et Kwok-Yung Yuen, « Coronavirus HKU15 in respiratory tract of pigs and first discovery of coronavirus quasispecies in 5'-untranslated region », PubMed, 2017 (PMID 28634353, PMCID 5584481, DOI 10.1038/emi.2017.37, lire en ligne, consulté le 22 janvier 2021).

v · m

Coronaviridae (famille des coronavirus)

Ordre : Nidovirales
Alphaletovirus (en) |  | Milecovirus |

* microhylae

|

Alphacoronavirus |  | Amalacovirus |

* almalfi

|

Colacovirus |

* myotis

Decacovirus |

* australiense
* ferrumequini (en)
* hipposideri
* rousetti (en)

Duvinacovirus |

* chicagoense

Luchacovirus |

* ratti

Minacovirus |

* neovisontis

Minunacovirus |

* miniopteri (en)
* pusilli (en)

Myotacovirus |

* ricketti

Nyctacovirus |

* chalinolobi
* nyctali (en)
* pipistrelli (en)
* tylonycteridis

Pedacovirus |

* finnoniense
* gouldii
* porci
* scotophili (en)

Rhinacovirus |

* rhinolophi (en)
* SADS-CoV

Setracovirus |

* amsterdamense
* triaenopis

Soracovirus |

* soricis

Sunacovirus |

* sunci

Tegacovirus |

* suis
* CCoV
* FCoV
* TGEV

Betacoronavirus |  | Embecovirus |

* gravedinis
* BCoV
* HCoV-OC43
* hongkongense
* muris
* RCV (en)
* myodae
* ratti

|

Hibecovirus |

* hipposideri

Merbecovirus |

* cameli
* MERS-CoV
* NeoCoV
* erinacei
* pipistrelli
* tylonycteridis

Nobecovirus |

* cororeum
* eidoli
* rousetti

Sarbecovirus |

* pandemicum
* 16BO133 (en)
* BANAL-52
* RaTG13
* RmYN02
* SARS-CoV
* SARS-CoV-2
* variants
* SHC014-CoV
* WIV1
* WIV16

Deltacoronavirus |  | Andecovirus |

* marecae

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Buldecovirus |

* gallinulae
* lonchurae
* pycnonoti
* suis
* zosteropis

Herdecovirus |

* nycticoracis

Gammacoronavirus |  | Brangacovirus |

* brantae

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Cegacovirus |

* delphinapteri

Igacovirus |

* Gammacoronavirus anatis
* galli
* pulli (en)

Alphapironavirus |  | Samovirus |

* salmonis

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