RAD9A

RAD9 гомолог A (S. pombe)

Представлено на основе PDB 3A1J.
Доступные структуры
PDB | Поиск ортологов: PDBe, RCSB

Список идентификаторов PDB

3A1J, 3G65, 3GGR

Идентификаторы
Символ | RAD9A ; RAD9
Внешние ID | OMIM: 603761  MGI: 1328356  HomoloGene: 32118  GeneCards: Ген RAD9A
номер EC | 3.1.11.2

Генная онтология

| Функция | • protein binding

• 3'-5' exonuclease activity
• exodeoxyribonuclease III activity
• SH3 domain binding
• enzyme binding
• protein kinase binding

• histone deacetylase binding

|

Компонент клетки | • nucleus

• nucleoplasm
• nucleolus
• cytoplasm

• checkpoint clamp complex

Биологический процесс | • DNA replication checkpoint

• DNA damage checkpoint
• DNA catabolic process, exonucleolytic
• DNA replication
• DNA repair
• cellular response to DNA damage stimulus
• intra-S DNA damage checkpoint
• cellular response to ionizing radiation
• nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis

• positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage

Источники: Amigo / QuickGO

Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид | Человек | Мышь |
Entrez | 5883 | 19367 |
Ensembl | ENSG00000172613 | ENSMUSG00000024824 |
UniProt | Q99638 | Q9Z0F6 |
RefSeq (мРНК) | NM_001243224 | NM_011237 |
RefSeq (белок) | NP_001230153 | NP_035367 |
Локус (UCSC) | Chr 11:
67.16 – 67.17 Mb | Chr 19:
4.2 – 4.2 Mb |
Поиск в PubMed | Искать | Искать |

Белок контрольной точки управления клеточным циклом RAD9A  — белок, кодируемый у человека геном RAD9A .[1]

## Содержание

* 1 Функция
* 2 Взаимодействия
* 3 Примечания
* 4 Литература

## Функция

[править | править код]

Этот продукт гена в высшей степени сходен с rad9 делящихся дрожжей, белком контрольной точки клеточного цикла, необходимым для клеточного цикла и репарации повреждений ДНК в ответ на её повреждение. Обнаружено, что этот белок обладает от 3' до 5' экзонуклеазной активностью, которая может внести свой вклад в его роль обнаружения и репарации повреждений ДНК. Он образует белковый комплекс контрольной точки с RAD1 и HUS1. Этот комплекс рекрутирует контрольную точку белка RAD17 на сайты повреждений ДНК, которые считается важным для запуска сигнализации каскада контрольных точек. Было отмечено использование альтернативных сайтов polyA для этого гена.[2]

## Взаимодействия

[править | править код]

RAD9A, как было выявлено, взаимодействует с:

* ABL1,[3]
* NR3C4,[4]
* BCL2L1,[5][6]
* BCL2,[6]
* DNAJC7,[7]
* HDAC1,[8]
* HUS1 [9][10][11][12]
* Гомолог RAD1,[9][10][11][12][13]
* RAD17 [9][13][14][15] и
* TOPBP1.[16]

## Примечания

[править | править код]

1. ↑ Lieberman H.B., Hopkins K.M., Nass M., Demetrick D., Davey S. A human homolog of the Schizosaccharomyces pombe rad9+ checkpoint control gene (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1997. — January (vol. 93, no. 24). — P. 13890—13895. — doi:10.1073/pnas.93.24.13890. — PMID 8943031. — PMC 19459.
2. ↑ Entrez Gene: RAD9A RAD9 homolog A (S. pombe)  (неопр.).
3. ↑ Yoshida K., Komatsu K., Wang H.G., Kufe D. c-Abl tyrosine kinase regulates the human Rad9 checkpoint protein in response to DNA damage (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2002. — May (vol. 22, no. 10). — P. 3292—3300. — doi:10.1128/mcb.22.10.3292-3300.2002. — PMID 11971963. — PMC 133797.
4. ↑ Wang L., Hsu C.L., Ni J., Wang P.H., Yeh S., Keng P., Chang C. Human checkpoint protein hRad9 functions as a negative coregulator to repress androgen receptor transactivation in prostate cancer cells (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2004. — March (vol. 24, no. 5). — P. 2202—2213. — doi:10.1128/mcb.24.5.2202-2213.2004. — PMID 14966297. — PMC 350564.
5. ↑ Rual J.F., Venkatesan K., Hao T., Hirozane-Kishikawa T., Dricot A., Li N., Berriz G.F., Gibbons F.D., Dreze M., Ayivi-Guedehoussou N., Klitgord N., Simon C., Boxem M., Milstein S., Rosenberg J., Goldberg D.S., Zhang L.V., Wong S.L., Franklin G., Li S., Albala J.S., Lim J., Fraughton C., Llamosas E., Cevik S., Bex C., Lamesch P., Sikorski R.S., Vandenhaute J., Zoghbi H.Y., Smolyar A., Bosak S., Sequerra R., Doucette-Stamm L., Cusick M.E., Hill D.E., Roth F.P., Vidal M. Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network (англ.) // Nature : journal. — 2005. — October (vol. 437, no. 7062). — P. 1173—1178. — doi:10.1038/nature04209. — PMID 16189514.
6. ↑ 1 2 Komatsu K., Miyashita T., Hang H., Hopkins K.M., Zheng W., Cuddeback S., Yamada M., Lieberman H.B., Wang H.G. Human homologue of S. pombe Rad9 interacts with BCL-2/BCL-xL and promotes apoptosis (англ.) // Nature Cell Biology : journal. — 2000. — January (vol. 2, no. 1). — P. 1—6. — doi:10.1038/71316. — PMID 10620799.
7. ↑ Xiang S.L., Kumano T., Iwasaki S.I., Sun X., Yoshioka K., Yamamoto K.C. The J domain of Tpr2 regulates its interaction with the proapoptotic and cell-cycle checkpoint protein, Rad9 (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications : journal. — 2001. — October (vol. 287, no. 4). — P. 932—940. — doi:10.1006/bbrc.2001.5685. — PMID 11573955.
8. ↑ Cai R.L., Yan-Neale Y., Cueto M.A., Xu H., Cohen D. HDAC1, a histone deacetylase, forms a complex with Hus1 and Rad9, two G2/M checkpoint Rad proteins (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2000. — September (vol. 275, no. 36). — P. 27909—27916. — doi:10.1074/jbc.M000168200. — PMID 10846170.
9. ↑ 1 2 3 Dufault V.M., Oestreich A.J., Vroman B.T., Karnitz L.M. Identification and characterization of RAD9B, a paralog of the RAD9 checkpoint gene (англ.) // Genomics : journal. — 2003. — December (vol. 82, no. 6). — P. 644—651. — doi:10.1016/s0888-7543(03)00200-3. — PMID 14611806.
10. ↑ 1 2 Volkmer E., Karnitz L.M. Human homologs of Schizosaccharomyces pombe rad1, hus1, and rad9 form a DNA damage-responsive protein complex (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1999. — January (vol. 274, no. 2). — P. 567—570. — doi:10.1074/jbc.274.2.567. — PMID 9872989.
11. ↑ 1 2 Griffith J.D., Lindsey-Boltz L.A., Sancar A. Structures of the human Rad17-replication factor C and checkpoint Rad 9-1-1 complexes visualized by glycerol spray/low voltage microscopy (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — May (vol. 277, no. 18). — P. 15233—15236. — doi:10.1074/jbc.C200129200. — PMID 11907025.
12. ↑ 1 2 Hirai I., Wang H.G. A role of the C-terminal region of human Rad9 (hRad9) in nuclear transport of the hRad9 checkpoint complex (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — July (vol. 277, no. 28). — P. 25722—25727. — doi:10.1074/jbc.M203079200. — PMID 11994305.
13. ↑ 1 2 Lindsey-Boltz L.A., Bermudez V.P., Hurwitz J., Sancar A. Purification and characterization of human DNA damage checkpoint Rad complexes (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2001. — September (vol. 98, no. 20). — P. 11236—11241. — doi:10.1073/pnas.201373498. — PMID 11572977. — PMC 58713.
14. ↑ Bermudez V.P., Lindsey-Boltz L.A., Cesare A.J., Maniwa Y., Griffith J.D., Hurwitz J., Sancar A. Loading of the human 9-1-1 checkpoint complex onto DNA by the checkpoint clamp loader hRad17-replication factor C complex in vitro (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — February (vol. 100, no. 4). — P. 1633—1638. — doi:10.1073/pnas.0437927100. — PMID 12578958. — PMC 149884.
15. ↑ Rauen M., Burtelow M.A., Dufault V.M., Karnitz L.M. The human checkpoint protein hRad17 interacts with the PCNA-like proteins hRad1, hHus1, and hRad9 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2000. — September (vol. 275, no. 38). — P. 29767—29771. — doi:10.1074/jbc.M005782200. — PMID 10884395.
16. ↑ Mäkiniemi M., Hillukkala T., Tuusa J., Reini K., Vaara M., Huang D., Pospiech H., Majuri I., Westerling T., Mäkelä T.P., Syväoja J.E. BRCT domain-containing protein TopBP1 functions in DNA replication and damage response (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — August (vol. 276, no. 32). — P. 30399—30406. — doi:10.1074/jbc.M102245200. — PMID 11395493.

## Литература

[править | править код]

* Lieberman H.B. Rad9, an evolutionarily conserved gene with multiple functions for preserving genomic integrity (англ.) // Journal of Cellular Biochemistry[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 97, no. 4. — P. 690—697. — doi:10.1002/jcb.20759. — PMID 16365875.
* Volkmer E., Karnitz L.M. Human homologs of Schizosaccharomyces pombe rad1, hus1, and rad9 form a DNA damage-responsive protein complex (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1999. — Vol. 274, no. 2. — P. 567—570. — doi:10.1074/jbc.274.2.567. — PMID 9872989.
* St Onge R.P., Udell C.M., Casselman R., Davey S. The Human G2 Checkpoint Control Protein hRAD9 Is a Nuclear Phosphoprotein That Forms Complexes with hRAD1 and hHUS1 (англ.) // Molecular Biology of the Cell : journal. — 1999. — Vol. 10, no. 6. — P. 1985—1995. — doi:10.1091/mbc.10.6.1985. — PMID 10359610. — PMC 25401.
* Komatsu K., Miyashita T., Hang H., Hopkins K.M., Zheng W., Cuddeback S., Yamada M., Lieberman H.B., Wang H.G. Human homologue of S. pombe Rad9 interacts with BCL-2/BCL-xL and promotes apoptosis (англ.) // Nature Cell Biology : journal. — 2000. — Vol. 2, no. 1. — P. 1—6. — doi:10.1038/71316. — PMID 10620799.
* Bessho T., Sancar A. Human DNA damage checkpoint protein hRAD9 is a 3' to 5' exonuclease (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 11. — P. 7451—7454. — doi:10.1074/jbc.275.11.7451. — PMID 10713044.
* Hang H., Lieberman H.B. Physical interactions among human checkpoint control proteins HUS1p, RAD1p, and RAD9p, and implications for the regulation of cell cycle progression (англ.) // Genomics : journal. — 2000. — Vol. 65, no. 1. — P. 24—33. — doi:10.1006/geno.2000.6142. — PMID 10777662.
* Cai R.L., Yan-Neale Y., Cueto M.A., Xu H., Cohen D. HDAC1, a histone deacetylase, forms a complex with Hus1 and Rad9, two G2/M checkpoint Rad proteins (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 36. — P. 27909—27916. — doi:10.1074/jbc.M000168200. — PMID 10846170.
* Burtelow M.A., Kaufmann S.H., Karnitz L.M. Retention of the human Rad9 checkpoint complex in extraction-resistant nuclear complexes after DNA damage (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 34. — P. 26343—26348. — doi:10.1074/jbc.M001244200. — PMID 10852904.
* Rauen M., Burtelow M.A., Dufault V.M., Karnitz L.M. The human checkpoint protein hRad17 interacts with the PCNA-like proteins hRad1, hHus1, and hRad9 (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 38. — P. 29767—29771. — doi:10.1074/jbc.M005782200. — PMID 10884395.
* Komatsu K., Wharton W., Hang H., Wu C., Singh S., Lieberman H.B., Pledger W.J., Wang H.G. PCNA interacts with hHus1/hRad9 in response to DNA damage and replication inhibition (англ.) // Oncogene : journal. — 2000. — Vol. 19, no. 46. — P. 5291—5297. — doi:10.1038/sj.onc.1203901. — PMID 11077446.
* Chen M.J., Lin Y.T., Lieberman H.B., Chen G., Lee E.Y. ATM-dependent phosphorylation of human Rad9 is required for ionizing radiation-induced checkpoint activation (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 19. — P. 16580—16586. — doi:10.1074/jbc.M008871200. — PMID 11278446.
* Burtelow M.A., Roos-Mattjus P.M., Rauen M., Babendure J.R., Karnitz L.M. Reconstitution and molecular analysis of the hRad9-hHus1-hRad1 (9-1-1) DNA damage responsive checkpoint complex (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 28. — P. 25903—25909. — doi:10.1074/jbc.M102946200. — PMID 11340080.
* Mäkiniemi M., Hillukkala T., Tuusa J., Reini K., Vaara M., Huang D., Pospiech H., Majuri I., Westerling T., Mäkelä T.P., Syväoja J.E. BRCT domain-containing protein TopBP1 functions in DNA replication and damage response (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 32. — P. 30399—30406. — doi:10.1074/jbc.M102245200. — PMID 11395493.
* St Onge R.P., Besley B.D., Park M., Casselman R., Davey S. DNA damage-dependent and -independent phosphorylation of the hRad9 checkpoint protein (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 45. — P. 41898—41905. — doi:10.1074/jbc.M105152200. — PMID 11551919.
* Xiang S.L., Kumano T., Iwasaki S.I., Sun X., Yoshioka K., Yamamoto K.C. The J domain of Tpr2 regulates its interaction with the proapoptotic and cell-cycle checkpoint protein, Rad9 (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications : journal. — 2001. — Vol. 287, no. 4. — P. 932—940. — doi:10.1006/bbrc.2001.5685. — PMID 11573955.
* Zou L., Cortez D., Elledge S.J. Regulation of ATR substrate selection by Rad17-dependent loading of Rad9 complexes onto chromatin (англ.) // Genes & Development : journal. — 2002. — Vol. 16, no. 2. — P. 198—208. — doi:10.1101/gad.950302. — PMID 11799063. — PMC 155323.
* Griffith J.D., Lindsey-Boltz L.A., Sancar A. Structures of the human Rad17-replication factor C and checkpoint Rad 9-1-1 complexes visualized by glycerol spray/low voltage microscopy (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2002. — Vol. 277, no. 18. — P. 15233—15236. — doi:10.1074/jbc.C200129200. — PMID 11907025.
* Hang H., Zhang Y., Dunbrack R.L., Wang C., Lieberman H.B. Identification and characterization of a paralog of human cell cycle checkpoint gene HUS1 (англ.) // Genomics : journal. — 2002. — Vol. 79, no. 4. — P. 487—492. — doi:10.1006/geno.2002.6737. — PMID 11944979.
* Yoshida K., Komatsu K., Wang H.G., Kufe D. c-Abl Tyrosine Kinase Regulates the Human Rad9 Checkpoint Protein in Response to DNA Damage (англ.) // Molecular and Cellular Biology : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 10. — P. 3292—3300. — doi:10.1128/MCB.22.10.3292-3300.2002. — PMID 11971963. — PMC 133797.