SARS-CoV-2

Эта статья о возбудителе заболевания; о болезни, вызываемой им, см. COVID-19.

SARS-CoV-2

Атомарная модель коронавируса SARS-CoV-2.
Цветовое обозначение:  — Мембрана — S протеин — E протеин — M протеин

— Глюкоза

Научная классификация

Группа:

Вирусы[1]

Реалм:

Riboviria

Царство:

Orthornavirae

Тип:

Pisuviricota

Класс:

Pisoniviricetes

Порядок:

Nidovirales

Подпорядок:

Cornidovirineae

Семейство:

Коронавирусы

Подсемейство:

Коронавирусы

Род:

Betacoronavirus

Подрод:

Sarbecovirus

Вид:

Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus

Без ранга:

SARS-CoV-2

Международное научное название
SARS-CoV-2
Синонимы

* 2019-nCoV

Группа по Балтимору
IV: (+)оцРНК-вирусы

Систематика
в Викивидах|
Изображения
на Викискладе|  | NCBI | 2697049

|

EOL | 61004213

SARS-CoV-2 (Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus 2[2], ранее 2019-nCoV[3][4]) — оболочечный одноцепочный (+)РНК-вирус[5][6], относящийся к подроду Sarbecovirus[англ.][7] рода Betacoronavirus[англ.][6][8].

SARS-CoV-2 впервые выявлен в декабре 2019 года, вызывает опасное инфекционное заболевание COVID-19[6].

В январе 2020 года Всемирная организация здравоохранения объявила вспышку эпидемии, связанной с SARS-CoV-2, чрезвычайной ситуацией в области здравоохранения международного значения[9], а 11 марта 2020 года охарактеризовала принявшее мировой масштаб распространение болезни как пандемию[10][11].

## Содержание

* 1 История изучения
* 2 Эпидемиология
* 2.1 Распространение вируса
* 3 Инфекция
* 4 Вирусология
* 4.1 Таксономия
* 4.2 Структурная биология
* 4.3 Варианты вируса
* 4.3.1 Мутации вируса
* 4.4 Иммунитет
* 5 Происхождение вируса
* 6 Жизнеспособность и перенос вне организма
* 7 Примечания
* 8 Литература
* 9 Ссылки

## История изучения

[править | править код]

Фотография клетки клеточной линии Vero E6, заражённой вирусами SARS-CoV-2 (оранжевые), при электронно-сканирующей микроскопии

Вирус SARS-CoV-2 впервые обнаружен в декабре 2019 года в результате анализа нуклеиновой кислоты у пациента с пневмонией[12]. 31 декабря 2019 года Всемирная организация здравоохранения была оповещена о нескольких случаях вирусной пневмонии, вызванной неизвестным патогеном. 7 января 2020 года информация о новом вирусе была подтверждена, а сам вирус был отнесён к коронавирусам[13]. Первыми геном вируса полностью расшифровали службы здравоохранения Китая[14], 10 января его сделали публично доступным[15]. До 12 января 5 геномов были зарегистрированы в базе данных GenBank[16][17], к 26 января их количество выросло до 28[18]. За исключением самого раннего генома, геномы находятся под эмбарго в GISAID[англ.]. Филогенетический анализ доступен через Nextrain[19]. 20 января 2020 года в китайской провинции Гуандун была подтверждена передача вируса от человека к человеку[20].

Коронавирусы, к которым относится SARS-CoV-2, обычно вызывают ОРВИ, но к этому же семейству относятся опасные вирусы SARS-CoV и MERS-CoV, вызывающие тяжёлый острый респираторный синдром и ближневосточный респираторный синдром соответственно[13]. Коронавирусная инфекция является зооантропонозной, то есть возможна передача от животных к человеку. Выяснено, что источником SARS-CoV были циветы, а MERS-CoV — одногорбые верблюды[21]. Возможно, что и в случае SARS-CoV-2 источником инфекции являются животные — генетический анализ вируса выявил схожесть с коронавирусами, распространёнными среди подковоносых летучих мышей, однако пока достоверно неизвестно, являются ли они изначальным источником инфекции. Сейчас же основным способом распространения вируса является передача от человека к человеку[22].➤

Учёные из разных стран проанализировали геном вируса и подтверждают тот факт, что вирус с очень большой долей вероятности имеет природное происхождение. Различные же теории заговоров создают атмосферу страха, слухи и предрассудки, подобные теории осуждаются научным сообществом. Вместе с генеральным директором ВОЗ учёные призывают продвигать научные доказательства вместо дезинформации[23].

## Эпидемиология

[править | править код]

Максимальный инкубационный период до 14 дней[24]. На стадии инкубационного периода выявление заболевших тепловизорами неэффективно, так как температура тела может быть в пределах нормы или быть незначительно завышенной[25].

По данным Центров по контролю и профилактике заболеваний США предполагается, что передача инфекции происходит микрокаплями (droplets) и аэрозолем. В клинических рекомендациях Министерства здравоохранения Российской Федерации указано, что механизм передачи вируса аэрозольный (воздушно-капельный, воздушно-пылевой пути) и контактный[26].

Согласно последним данным, SARS-CoV-2 (как и SARS-CoV-1) способен оставаться жизнеспособным вне организма от 3 часов до 4 дней в зависимости от поверхности объекта[27]. Наиболее стабильно вирус сохраняется на нержавеющей стали (2 суток) и пластике (3 суток). В этот период его концентрация снижается больше, чем на 3 порядка. В зависимости от условий концентрация вируса уменьшается в 2 раза на нержавеющей стали за первые 3-7 часов, а на пластике — за первые 5,5-9 часов. В воздухе концентрация вируса падает на порядок за 3 часа в лабораторных условиях, в то время как на стали — за 18-19 часов, а на пластике — за 20 часов и в редких исключениях за 22 часа. Нет какого-либо риска заражения при получении посылок или писем[28].

Индекс репродукции, по данным Китайского центра по контролю и профилактике заболеваний, оценивается между 2 и 3, что по определению индекса соответствует количеству людей, которые заражаются от одного инфицированного, одно из исследований оценило среднее значение по состоянию на 22 января 2020 года в 2,2 (другое ранее проведённое исследование показывало диапазон 3,3—5,47[29][неавторитетный источник]). В общем случае, значения данного числа, большие 1, означают, что эпидемия будет распространяться, а уменьшить число помогают меры противодействия распространению инфекции[30].

### Распространение вируса

[править | править код]

Основная статья: Пандемия COVID-19

Карта распространения вируса

Первые случаи заболевания COVID-19 были зарегистрированы в декабре 2019 года в китайском городе Ухань. Большинство заболевших китайские власти связали с местным оптовым рынком морепродуктов Хуанань, где продавались живые животные[31]. На ранних этапах количество заражённых удваивалось примерно каждые 7,5 дней[32]; к середине января 2020 года вирус проник и в другие провинции Китая — этому способствовал статус Уханя как важного транспортного узла и возросшее число поездок в связи с приближающимся китайским Новым годом[33]. Зимой 2019—2020 годов большинство новых случаев заболевания и смертей приходилось на Хубэй — провинцию Китая, центром которой является Ухань; однако уже 26 февраля количество новых случаев COVID-19 за пределами Китая превысило количество заражений в пределах этой страны[34]. В конце января 2020 года Всемирная организация здравоохранения присвоила распространению заболевания статус «чрезвычайной ситуации международного значения»[9], а в марте охарактеризовала его как пандемию[10].

## Инфекция

[править | править код]

Основная статья: COVID-19

Инфекция может протекать как в форме лёгкой острой респираторной вирусной инфекции[35], так и в тяжёлой форме[36]. У большинства людей болезнь заканчивается выздоровлением, при этом специфических лечебных мероприятий не требуется[37]. Осложнения тяжёлых случаев могут включать пневмонию или дыхательную недостаточность с риском смерти[38][39].

## Вирусология

[править | править код]

### Таксономия

[править | править код]

SARS-CoV-2 в таксономии коронавирусов[40][40]

Coronaviridae | Orthocoronavirinae | Alphacoronavirus
Betacoronavirus[англ.] | Sarbecovirus[нем.] | SARSr-CoV[англ.] | SARS-CoV-1
SARS-CoV-2
...
Merbecovirus | MERS-CoV
...
Embecovirus | HCoV-HKU1
Betacoronavirus 1[фр.] | HCoV-OC43
...
Gammacoronavirus
Deltacoronavirus
Letovirinae
Предполагаемая организация генома коронавируса SARS-CoV-2

Последовательности бетакоронавируса[англ.] обнаруживают сходство с бетакоронавирусами, выявленными у летучих мышей из Китая. Однако вирус генетически отличается от других коронавирусов, которые вызывают[41]:

* тяжёлый острый респираторный синдром (SARS), известный также как атипичная пневмония, вызываемый вирусом SARS-CoV;
* ближневосточный респираторный синдром (MERS), вызываемый вирусом MERS-CoV.

SARS-CoV-2, как и SARS-CoV, является членом линии Beta-CoV B[41].

### Структурная биология

[править | править код]

Модель поперечного сечения большинства представителей группы Beta-CoV B. Однако у вирусных частиц SARS-CoV-2 отсутствует белок Hemagglutinin esterase (HE)

По состоянию на 29 марта 2020 года выделено 2058 геномов вируса SARS-CoV-2, в котором уже заметны тенденции к эволюционированию. Как минимум 7 мутаций относятся к одному предку[42].

Длина РНК-последовательности SARS-CoV-2 составляет около 30 000 нуклеотидов.

РНК варианта Wuhan-Hu-1[16] (номер GenBank MN908947, RefCeq NC_045512[18]) SARS-CoV-2 содержит 29 903 нуклеотида с нетранслируемыми участками длиной 281 и 325 нуклеотидов. Предполагаемые кодирующие области распределены по 10 белкам.

Генетически вирус на 80 % идентичен SARS-CoV[источник не указан 1163 дня].

Схематичный рисунок строения вириона коронавирусов и его шипа: RNA — одноцепочечная РНК, N — нуклеокапсидный белок[англ.], M — мембранный белок[англ.], E — оболочечный белок[англ.], Spike — шип представленный гликопротеином[англ.], RBD — рецептор-связывающий домен[англ.], S1 — область белка являющаяся кодоменом связывания (рецептор-связывающий мотив), S2 — область белка ответственная[англ.] за слияние[англ.] оболочки вируса и цитолеммы клетки

Размер вириона порядка 50-200 нанометров. Белковое моделирование, осуществлённое на основе расшифрованного генома вируса, показало, что рецептор-связывающий гликопротеин шипа коронавирусов[англ.] может иметь достаточно высокую аффинность к белку человека ангиотензинпревращающий фермент 2 (АПФ2, англ. ACE2) и использовать его как точку входа в клетку[43]. В конце января 2020 года две группы в Китае и США независимо друг от друга экспериментально показали, что именно АПФ2 является рецептором для вируса SARS-CoV-2[44][45][46], так же как и для вируса SARS-CoV[47]. В марте 2020 в препринте статьи было выдвинуто предположение, что вирус для проникновения в клетки человека использует белок SP, с помощью которого взаимодействует с белком басигином (CD147) заражаемой клетки человека[48][49].

### Варианты вируса

[править | править код]

Основная статья: Штаммы SARS-CoV-2

Информация в этом разделе устарела.

Вы можете помочь проекту, обновив её и убрав после этого данный шаблон. (4 июля 2020)

|

С начала вспышки болезни в Китае до марта 2020 года, на основе анализа 103 публично доступных геномов SARS-CoV-2 было обнаружено не менее 149 изменений[источник не указан 1807 дней]. Как показало исследование[какое?], коронавирус выделился в два подтипа: наиболее часто встречающийся L (70 %) и S (30 %). Подтип L чаще встречался на ранних этапах вспышки в Ухане, однако к началу января 2020 года его частота снизилась. Человеческое вмешательство оказало сильное селективное давление на этот подтип, который может быть более агрессивен и распространяется быстрее. С другой стороны, сравнительная распространённость подтипа S, который эволюционно старее и менее агрессивен, вероятно, возросла в силу более слабого селективного давления[50][51].

Анализ 160 образцов генома SARS-CoV-2, выделенных у заболевших людей, показал, что разновидности коронавируса A и C распространены у европейцев и американцев, а разновидность B наиболее распространена в Восточной Азии[52][53].

#### Мутации вируса

[править | править код]

Этот раздел нуждается в переработке. Пожалуйста, уточните проблему в разделе с помощью более узкого шаблона.

Пожалуйста, улучшите статью в соответствии с правилами написания статей. (29 января 2022)

|

Были обнаружены сотни мутаций SARS-CoV-2. Учёные работают над тем, чтобы установить, как это влияет на заразность и смертельность вируса. Учёные из Национальной лаборатории Лос-Аламос в штате Нью-Мексико анализируют вариации «шипа» вируса, придающего ему выразительную форму. По данным Global Initiative on Sharing All Influenza Data (GISAID), исследователи провели анализ информации из Британии на предмет заражённых коронавирусом в Шеффилде[источник не указан 1163 дня].

По результатам тестов было выявлено большее количество COVID-19 с такой мутацией вируса у людей. Учёные, однако, не выявили доказательств, что эти люди переболели коронавирусной инфекцией в тяжёлой форме или провели больше времени в больнице[источник не указан 1163 дня].

Исследователи в Университетском колледже Лондона смогли выявить 198 повторяющихся мутаций вируса. Франсуа Баллу сообщил: «Мутации сами по себе не являются чем-то плохим, и пока нет данных, позволяющих предположить, что SARS-CoV-2 мутирует быстрее или медленнее, чем ожидалось»[источник не указан 1163 дня].

Представители ВОЗ сообщили, что мутация D614G была выявлена в феврале и известно около 50 цепочек вируса.[источник не указан 1740 дней]

Молекулярные биологи из Нью-Йоркского геномного центра и Нью-Йоркского университета заявили:

> Широко распространённая мутация D614G значительно ускоряет передачу вируса между самыми разными типами человеческих клеток, включая клетки из лёгких, печени и кишечника. Одной из причин повышенной заразности вируса может быть то, что эта мутация делает SARS-CoV-2 более стойким к человеческим ферментам.

> — [54][неавторитетный источник]

* 501.V2 Variant, найден в Южной Африке[55]
* Кластер 5, найден в Дании. Результатом обнаружения стал карантин и умерщвление норок.[56]
* VOC-202012/01, найден в Великобритании[57]
* Омикрон-штамм SARS-CoV-2, выявлен в Ботсване, ЮАР в ноябре 2021 года[58][59]
* B.1.640.2, выявлен в ноябре 2021 года на юге Франции[60][61]

### Иммунитет

[править | править код]

Иммунитет у переболевших сохраняется до 15 месяцев.[1] Со временем иммунитет ослабевает, и примерно через 6 месяцев после первоначального заражения защита от повторного составляла примерно 80 % без существенной разницы в показателях повторного заражения между мужчинами и женщинами. Но для лиц в возрасте 65 лет и старше эта защита уменьшается до 47 %. В другом исследовании на протяжении 9 месяцев брали анализы у более чем 9500 человек из примерно 3500 случайно выбранных домохозяйств в Ухане, в результате около 40 % инфицированных вырабатывали нейтрализующие антитела, которые можно было обнаружить за весь период исследования[62].

## Происхождение вируса

[править | править код]

22 января 2020 года медицинский журнал «Journal of Medical Virology[англ.]» опубликовал исследование китайских учёных, в котором пять геномов вируса SARS-CoV-2 сопоставили с 276 известными геномными последовательностями коронавирусов, поражающих людей и различных животных. По мнению учёных, построенное филогенетическое древо коронавирусов показывает, что новые вирусы появились ориентировочно два года назад от одного общего предка путём гомологичной рекомбинации между коронавирусом летучей мыши и, возможно, коронавирусом китайских змей — южнокитайского многополосного крайта или китайской кобры (обе разновидности змей продавались на рынке в Ухане в качестве пищи[англ.])[63][64]

Однако ряд исследователей в статье, опубликованной в журнале Nature, оспаривает подобный вывод китайских учёных[65][66] и утверждает, что, с их точки зрения, маловероятно, что в качестве источника заражения могли выступить змеи, где наиболее вероятными кандидатами на эту роль являются млекопитающие и птицы. По мнению Пауло Эдуардо Брандао, вирусолога из Университета Сан-Паулу, китайские учёные не предоставили доказательств того, что змеи могут заражаться новым коронавирусом и служат для него носителем, в том числе поскольку нет надёжных доказательств наличия коронавирусов у носителей, кроме млекопитающих и птиц. Цуй Цзе, вирусолог из Шанхайского института Пастера, входивший в группу, выявившую в 2017 году вирусы, связанные с атипичной пневмонией у летучих мышей, сообщает, что полевые работы после вспышки атипичной пневмонии в 2002—2003 годах обнаружили такие вирусы только у млекопитающих[источник не указан 1869 дней].

Другая группа китайских учёных предположила[67], что источником вируса SARS-CoV-2 являются летучие мыши, поскольку РНК образцов SARS-CoV-2 на 96 % совпала с РНК вируса, который ранее находили у азиатских подковоносов (лат. Rhinolophus affinis[нем.]). Кроме того, коронавирус SARS-CoV-2 на 79,5 % похож на вирус атипичной пневмонии, эпидемия которой началась в Китае в 2002 году[68]. Исследователи из Южно-Китайского сельскохозяйственного университета в Гуанчжоу и Университета Квебека в Монреале считают, что источником нового коронавируса могли стать панголины[69][70].

Авторы работы, опубликованной в Nature Microbiology, определили, что SARS-CoV-2 и вирус летучей мыши RaTG13[англ.], выделенный из летучей мыши вида Rhinolophus affinis, разделились от 40 до 70 лет назад. Рассчитанная с помощью трёх разных биоинформатических подходов максимальная вероятность этого события пришлась на 1948, 1969 или 1982 год[71][72]. Изменения хозяина вируса обычно связаны с новыми адаптациями, позволяющими оптимально использовать клетки нового вида хозяина, SARS-CoV-2, по-видимому, практически не требовал значительной адаптации к человеку с момента начала пандемии. Наиболее близкий к SARS-CoV-2 вирус летучих мышей RmYN02[англ.] (общий предок около 1976 года) имеет явные доказательства коинфекции и эволюции у летучих мышей без участия других видов. Прародитель SARS-CoV-2 способен к эффективной передаче от человека к человеку в результате своей адаптивной эволюционной истории у летучих мышей, а не у людей[73].

## Жизнеспособность и перенос вне организма

[править | править код]

Основная статья: Жизнеспособность и перенос SARS-CoV-2 вне организма

SARS-CoV-2 является вирусом с оболочкой. Липидный бислой оболочки таких вирусов довольно чувствителен к высыханию, повышенной температуре и дезинфицирующим агентам, поэтому такие вирусы легче поддаются стерилизации, чем непокрытые вирусы, хуже выживают вне хозяйской клетки и обычно передаются от хозяина к хозяину.

К марту 2020 года во многих странах мира не существовало достаточно полных и достоверных оценок жизнестойкости и сохранения активности вируса вне организма, из-за большого количества влияющих факторов, относительно незначительного времени наблюдения и небольшого количества полученных данных, пандемия только разгоралась.

Однако в Китае к 29 марта 2020 года с новой коронавирусной пневмонией, которой там к тому времени переболели десятки тысяч человек, уже удалось справиться. И в изданной в этом месяце Пекинским медицинским университетом[кит.] книге «110 вопросов из области знаний по эпидемиологии новой коронавирусной пневмонии» отмечалось, что новый коронавирус чувствителен к ультрафиолетовому излучению и нагреванию, теряет жизнеспособность после 30 мин при температуре 56 °C, после дезинфекции диэтиловым эфиром, 75-процентным раствором этилового спирта, дезинфицирующим средством содержащим хлор, надуксусной кислотой, хлороформом или другими растворителями жиров[74].

Известны следующие оценки в соответствии с анализом, проведённым специалистами университета Сунь Ятсена (Чжуншань): оптимальными условиями для передачи коронавируса являются температура воздуха от 5 до 8 °C, а также влажность 35-50 %[75][неавторитетный источник]. Такие результаты были получены в ходе анализа пиков заболеваемости в период с 20 января по 4 февраля 2020 года в Китае и ещё 26 странах, в общей сложности на основе 24 139 подтверждённых случаев заболевания, из которых 68,01 % пациентов были выходцами из провинции Хубэй. При этом были учтены инкубационный период, а также карантинные меры, которые постепенно вводились в разных городах. Исследование показало, что активность Covid-19 при превышении температуры 8,72 °C шла на спад. При 30 °C его инфекционная скорость становилась нулевой.

В ходе исследований учёные Университета Гонконга выявили[76][неавторитетный источник][77][неавторитетный источник], что коронавирус остаётся высокостабильным в течение долгого времени при температуре около четырёх градусов, и при отсутствии дезинфекции его активность начнёт снижаться только через 14 дней. При этом вирус не переносит высокие температуры и при 70 градусах дезактивируется в течение пяти минут. По их данным, на бумаге вирус не был выявлен уже спустя три часа, на одежде и обработанном дереве вирус держался до двух дней, на стекле — до четырёх дней, а на пластике — до семи. На внешней поверхности медицинских масок сохраняется до семи дней, что указывает на необходимость их тщательной дезинфекции.

По результатам исследований нескольких научных центров США, вирус может оставаться жизнеспособным в воздухе спустя три часа, на медной поверхности — до четырёх часов, на картоне — 24 часа, на пластике и нержавеющей стали — до двух-трёх дней[78][неавторитетный источник].

## Примечания

[править | править код]

1. ↑ Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
2. ↑ Communicable disease threats report, 9-15 February 2020, week 7 (неопр.). ECDC (10 февраля 2020). Дата обращения: 14 февраля 2020. Архивировано 22 февраля 2020 года.
3. ↑ Wu et al., 2020.
4. ↑ Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (англ.). Taxonomy browser. NCBI. Дата обращения: 26 января 2020. Архивировано 3 февраля 2020 года.
5. ↑ Anthony R. Fehr, Stanley Perlman. Coronaviruses: An Overview of Their Replication and Pathogenesis // Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). — 2015. — Т. 1282. — С. 1—23. — ISSN 1064-3745. — doi:10.1007/978-1-4939-2438-7_1. — PMID 25720466. Архивировано 30 января 2020 года.
6. ↑ 1 2 3 Nicholas J. Beeching, Tom E. Fletcher, Robert Fowler. COVID-19 (неопр.). BMJ Best Practices. BMJ Publishing Group (17 февраля 2020). Дата обращения: 30 марта 2020. Архивировано 22 февраля 2020 года.
7. ↑ Gurjit S. Randhawa et al. Machine learning using intrinsic genomic signatures for rapid classification of novel pathogens: COVID-19 case study Архивная копия от 5 марта 2022 на Wayback Machine, April 24, 2020
8. ↑ Щелканов М. Ю., Попова А. Ю., Дедков В. Г., Акимкин В. Г., Малеев В. В. История изучения и современная классификация коронавирусов (Nidovirales: Coronaviridae) (рус.) // Инфекция и иммунитет : научная статья. — 2020. — Т. 10, № 2. — С. 221—246. Архивировано 25 июня 2020 года.
9. ↑ 1 2 Novel Coronavirus(2019-nCoV) Situation Report - 11 (неопр.). World Health Organisation (31 января 2020). Дата обращения: 1 февраля 2020. Архивировано 1 февраля 2020 года.
10. ↑ 1 2 WHO Director-General's opening remarks at the media briefing on COVID-19 — 11 March 2020 (неопр.). Дата обращения: 12 марта 2020. Архивировано 11 марта 2020 года.
11. ↑ ВОЗ объявила о пандемии коронавируса (неопр.) (11 марта 2020). Дата обращения: 11 марта 2020. Архивировано 12 марта 2020 года.
12. ↑ New-type coronavirus causes pneumonia in Wuhan : expert :  [англ.] // News. — Xinhua. — Дата обращения: 09.01.2020.
13. ↑ 1 2 WHO, Novel Coronavirus (2019-nCoV).
14. ↑ CDC, Novel Coronavirus 2019 Situation Summary.
15. ↑ European Centre for Disease Prevention and Control, Event background, p. 2.
16. ↑ 1 2 Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome (англ.). — 2020-01-23. Архивировано 11 января 2022 года.
17. ↑ Novel 2019 coronavirus genome (англ.). Virological (11 января 2020). Дата обращения: 1 февраля 2020. Архивировано 20 января 2020 года.
18. ↑ 1 2 2019-nCoV Sequences (Wuhan coronavirus) (англ.). National Center for Biotechnology Information (USA). Дата обращения: 1 февраля 2020. Архивировано 31 января 2020 года.
19. ↑ Genomic epidemiology of novel coronavirus (nCoV) using data generated by Fudan University, China CDC, Chinese Academy of Medical Sciences, Chinese Academy of Sciences, Zhejiang Provincial Center for Disease Control and Prevention and the Thai National Institute of Health shared via GISAID (неопр.). nextstrain.org. Дата обращения: 1 февраля 2020. Архивировано 2 ноября 2021 года.
20. ↑ China confirms human-to-human transmission of new coronavirus (англ.). CBC News (20 января 2020). Дата обращения: 21 января 2020. Архивировано 20 января 2020 года.
21. ↑ WHO, Coronavirus.
22. ↑ Questions and Answers on 2019novel-Coronavirus. Scientific expertise (англ.). OIE. World Organisation for Animal Health. Дата обращения: 26 января 2020. Архивировано 26 января 2020 года.
23. ↑ Charles Calisher, Dennis Carroll, Rita Colwell, Ronald B Corley, Peter Daszak et al. Statement in support of the scientists, public health professionals, and medical professionals of China combatting COVID-19 (англ.) // The Lancet : Correspondence. — Elsevier, 2020. — 18 February. — doi:10.1016/S0140-6736(20)30418-9. Архивировано 18 февраля 2020 года.
24. ↑ European Centre for Disease Prevention and Control, Third update, ECDC risk assessment for the EU/EEA, General assessment, p. 3.
25. ↑ Снять «корону»: в РФ создают тест для выявления «китайской» пневмонии (неопр.). Архивировано 27 января 2020 года.
26. ↑ Временные методические рекомендации (неопр.). Минздрав России (29 января 2020). Дата обращения: 1 февраля 2020. Архивировано 20 февраля 2020 года.. Данная информация основана на сильно устаревших данных: версии 1 от 29.01.2020. Последняя актуальная на начало ноября 2021 года: версия 13 от 14.10.2021 года Архивная копия от 31 октября 2021 на Wayback Machine
27. ↑ Neeltje van Doremalen, Trenton Bushmaker, Dylan H. Morris, Myndi G. Holbrook, Amandine Gamble. Aerosol and Surface Stability of SARS-CoV-2 as Compared with SARS-CoV-1 (англ.) // New England Journal of Medicine. — 2020-03-17. — P. NEJMc2004973. — ISSN 1533-4406 0028-4793, 1533-4406. — doi:10.1056/NEJMc2004973. Архивировано 28 марта 2020 года.
28. ↑ Novel Coronavirus (2019-nCoV) advice for the public: Myth busters (англ.). World Health Organization. Дата обращения: 30 января 2020. Архивировано 14 июня 2020 года.
29. ↑ Zhao, Shi; Ran, Jinjun; Musa, Salihu Sabiu; Yang, Guangpu; Lou, Yijun; Gao, Daozhou; Yang, Lin; He, Daihai. Preliminary estimation of the basic reproduction number of novel coronavirus (англ.) // biorxiv. — 2019. — 24 January. Архивировано 30 января 2020 года.
30. ↑ Qun Li, Xuhua Guan, Peng Wu, Xiaoye Wang, Lei Zhou. Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus–Infected Pneumonia // New England Journal of Medicine. — 2020-01-29. — Т. 0, вып. 0. — С. null. — ISSN 0028-4793. — doi:10.1056/NEJMoa2001316. Архивировано 16 июля 2020 года.
31. ↑ Novel Coronavirus Pneumonia Emergency Response Epidemiology Team. [The epidemiological characteristics of an outbreak of 2019 novel coronavirus diseases (COVID-19) in China] (кит.) // Zhonghua Liu Xing Bing Xue Za Zhi = Zhonghua Liuxingbingxue Zazhi. — 2020. — 2月 (第41卷, 第2数). — 第145—151 页. — doi:10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2020.02.003. — PMID 32064853.
32. ↑ Li Q., Guan X., Wu P., Wang X., Zhou L., Tong Y., Ren R., Leung K. S., Lau E. H., Wong J. Y., Xing X., Xiang N., Wu Y., Li C., Chen Q., Li D., Liu T., Zhao J., Li M., Tu W., Chen C., Jin L., Yang R., Wang Q., Zhou S., Wang R., Liu H., Luo Y., Liu Y., Shao G., Li H., Tao Z., Yang Y., Deng Z., Liu B., Ma Z., Zhang Y., Shi G., Lam T. T., Wu J. T., Gao G. F., Cowling B. J., Yang B., Leung G. M., Feng Z. Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus-Infected Pneumonia (англ.) // The New England Journal of Medicine : journal. — 2020. — January. — doi:10.1056/NEJMoa2001316. — PMID 31995857.
33. ↑ WHO-China Joint Mission. Report of the WHO-China Joint Mission on Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) (неопр.). World Health Organization (16 февраля 2020). Дата обращения: 8 марта 2020. Архивировано 29 февраля 2020 года.
34. ↑ WHO Director-General's opening remarks at the mission briefing on COVID-19 – 26 February 2020 (неопр.). World Health Organization (26 февраля 2020). Дата обращения: 12 марта 2020. Архивировано 6 мая 2020 года.
35. ↑ Временные методические рекомендации (неопр.). Минздрав России. Министерство здравоохранения Российской Федерации (29 января 2020). Дата обращения: 16 марта 2022. Архивировано 29 декабря 2021 года.
36. ↑ Clinical management of severe acute respiratory infection when novel coronavirus (nCoV) infection is suspected. — 2020. — 28 января.
37. ↑ Вопросы и ответы о COVID-19 (рус.). Всемирная организация здравоохранения. Дата обращения: 1 марта 2020. Архивировано 25 апреля 2020 года.
38. ↑ Symptoms // 2019 Novel Coronavirus, Wuhan, China. — Centers For Disease Control and Prevention (CDC).
39. ↑ Novel Coronavirus(2019-nCoV). Situation Report - 8 (неопр.). World Health Organization (20 января 2020). Дата обращения: 30 января 2020. Архивировано 2 февраля 2020 года.
40. ↑ 1 2 NCBI. taxonomy browser (англ.). ncbi.nlm.nih.gov. Архивная копия от 2 декабря 2021 на Wayback Machine Источник (неопр.). Дата обращения: 2 декабря 2021. Архивировано 2 декабря 2021 года.
41. ↑ 1 2 Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses (англ.). nextstrain. Дата обращения: 18 января 2020. Архивировано 20 января 2020 года.
42. ↑ Nextstrain.
43. ↑ Xu, X. Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission :  [англ.] / X. Xu, P. Chen, J. Wang … [et al.] // Science China Life Sciences : j. — doi:10.1007/s11427-020-1637-5. — PMID 32009228.
44. ↑ Letko, Michael; Munster, Vincent. Functional assessment of cell entry and receptor usage for lineage B β-coronaviruses, including 2019-nCoV (англ.) // BiorXiv : journal. — 2020. — 22 January. — P. 2020.01.22.915660. — doi:10.1101/2020.01.22.915660. Архивировано 7 декабря 2021 года.
45. ↑ Zhou, Peng; Shi, Zheng-Li. Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin (англ.) // BiorXiv : journal. — 2020. — P. 2020.01.22.914952. — doi:10.1101/2020.01.22.914952. Архивировано 24 января 2020 года.
46. ↑ Gralinski, Lisa E. Return of the Coronavirus : 2019-nCoV :  [англ.] / Lisa E. Gralinski, Vineet D. Menachery // Viruses. — 2020. — Vol. 12, no. 2 (24 January). — P. 135. — doi:10.3390/v12020135. — PMID 31991541.
47. ↑ European Centre for Disease Prevention and Control, Novel coronavirus (2019-nCoV) infections, p. 8.
48. ↑ Ke Wang, Wei Chen, Yu-Sen Zhou, Jian-Qi Lian, Zheng Zhang, Peng Du, Li Gong, Yang Zhang, Hong-Yong Cui, Jie-Jie Geng, Bin Wang, Xiu-Xuan Sun, Chun-Fu Wang, Xu Yang, Peng Lin, Yong-Qiang Deng, Ding Wei, Xiang-Min Yang, Yu-Meng Zhu, Kui Zhang, Zhao-Hui Zheng, Jin-Lin Miao, Ting Guo, Ying Shi, Jun Zhang, Ling Fu, Qing-Yi Wang, Huijie Bian, Ping Zhu, Zhi-Nan Chen. SARS-CoV-2 invades host cells via a novel route: CD147-spike protein (англ.) // BioRxiv : journal. — doi:10.1101/2020.03.14.988345.
49. ↑ Лосева Полина. У клеток человека нашли вторую «дверь» для коронавируса (неопр.). nplus1.ru (16 марта 2020). Дата обращения: 18 марта 2020. Архивировано 18 марта 2020 года.
50. ↑ «Китайские ученые рассказали о мутациях коронавируса». ПЕКИН, 4 марта 2020 — РИА Новости. (неопр.) Дата обращения: 4 марта 2020. Архивировано 4 марта 2020 года.
51. ↑ Xiaolu Tang, Changcheng Wu, Xiang Li, Yuhe Song, Xinmin Yao. On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2 (англ.) // National Science Review. — doi:10.1093/nsr/nwaa036. Архивировано 28 марта 2020 года.
52. ↑ Peter Forster, Lucy Forster, Colin Renfrew, Michael Forster. Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes Архивная копия от 13 апреля 2020 на Wayback Machine, April 8, 2020
53. ↑ Genetic Study Identifies Three Variants of SARS-CoV-2 Coronavirus Архивная копия от 23 апреля 2020 на Wayback Machine, Apr 9, 2020
54. ↑ [eadaily.com/ru/news/2020/06/16/biologi-ssha-covid-19-bystro-mutiruet-skorost-zarazheniya-vyrosla-do-8-raz Биологи США: Covid-19 быстро мутирует, скорость заражения выросла до 8 раз] (рус.). EADaily (16 июня 2020). Дата обращения: 3 июля 2020. Архивировано 30 июня 2020 года.
55. ↑ South Africa announces a new coronavirus variant (неопр.). The New York Times (18 декабря 2020). Дата обращения: 23 декабря 2020. Архивировано 21 декабря 2020 года.
56. ↑ Noack, Rick; Farzan, Antonia Noori. Danish government halts plans to kill more than 15 million minks over coronavirus scare. Washington Post (англ.). ISSN 0190-8286. Архивировано 12 декабря 2020. Дата обращения: 27 декабря 2020.
57. ↑ Chand, Meera; Hopkins, Susan; Dabrera, Gavin; Achison, Christina; Barclay, Wendy; Ferguson, Neil; Volz, Erik; Loman, Nick; Rambaut, Andrew; Barrett, Jeff (21 декабря 2020). Investigation of novel SARS-COV-2 variant: Variant of Concern 202012/01 (PDF) (Report). Public Health England. Архивировано (PDF) 22 февраля 2021. Дата обращения: 23 декабря 2020.
58. ↑ Ewen Callaway. Heavily mutated Omicron variant puts scientists on alert (англ.) // Nature. — 2021-11-25. — Vol. 600, iss. 7887. — P. 21–21. — doi:10.1038/d41586-021-03552-w. Архивировано 26 ноября 2021 года.
59. ↑ Luke Andrews. New Botswana variant with 32 'horrific' mutations (неопр.). Mail Online (24 ноября 2021). Дата обращения: 5 января 2022. Архивировано 27 ноября 2021 года.
60. ↑ Новый штамм коронавируса обнаружили во Франции (рус.). Lenta.RU. Дата обращения: 5 января 2022. Архивировано 4 января 2022 года.
61. ↑ Philippe Colson, Jérémy Delerce, Emilie Burel, Jordan Dahan, Agnès Jouffret. Emergence in Southern France of a new SARS-CoV-2 variant of probably Cameroonian origin harbouring both substitutions N501Y and E484K in the spike protein (англ.). — 2021-12-29. — P. 2021.12.24.21268174. — doi:10.1101/2021.12.24.21268174v1. Архивировано 4 января 2022 года.
62. ↑ Nature (2021). COVID research: a year of scientific milestones. Nature (англ.). doi:10.1038/d41586-020-00502-w. Архивировано 3 января 2022. Дата обращения: 30 июня 2021.
63. ↑ Ji et al., 2020.
64. ↑ Лосева, Полина. Китайский коронавирус оказался гибридом вирусов змеи и летучей мыши (неопр.). N+1 (23 января 2020). Дата обращения: 23 января 2020. Архивировано 25 января 2020 года.
65. ↑ Callaway & Cyranoski, 2020.
66. ↑ Megan, Molteni. Snakes?! The Slippery Truth of a Flawed Wuhan Virus Theory. One paper advanced a controversial theory about the disease's origin. Other scientists aren't biting (неопр.). Wired! (23 января 2020). Дата обращения: 24 января 2020. Архивировано 24 января 2020 года.
67. ↑ Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin Архивная копия от 24 января 2020 на Wayback Machine / коллектив авторов, doi: https://doi.org/10.1101/2020.01.22.914952 // Препринт на bioRxiv. 23.01.2020 г.
68. ↑ Zhou et al., 2020.
69. ↑ Cyranoski, David (26 февраля 2020). Mystery deepens over animal source of coronavirus. Nature (англ.). 579 (7797): 18–19\. Bibcode:2020Natur.579...18C. doi:10.1038/d41586-020-00548-w. Архивировано 1 апреля 2020. Дата обращения: 12 апреля 2020.18-19&rft.date=2020-02-26&rft_id=info:doi/10.1038/d41586-020-00548-w&rft_id=info:bibcode/2020Natur.579...18C&rft.aulast=Cyranoski&rft.aufirst=David&rft_id=https://www.nature.com/articles/d41586-020-00548-w&rfr_id=info:sid/ru.wikipedia.org:SARS-CoV-2" class="Z3988">
70. ↑ Makarenkov V. et al. Horizontal gene transfer and recombination analysis of SARS-CoV-2 genes helps discover its close relatives and shed light on its origin Архивная копия от 7 июня 2021 на Wayback Machine, BMC Ecology and Evolution 21, 2021
71. ↑ Maciej F. Boni et al. Evolutionary origins of the SARS-CoV-2 sarbecovirus lineage responsible for the COVID-19 pandemic Архивная копия от 24 декабря 2020 на Wayback Machine, 28 July 2020
72. ↑ Елена Клещенко. Общий предок SARS-CoV-2 и известных родственных вирусов летучих мышей существовал десятки лет назад Архивная копия от 25 ноября 2020 на Wayback Machine, 28.07.2020
73. ↑ Oscar A. MacLean et al. Natural selection in the evolution of SARS-CoV-2 in bats created a generalist virus and highly capable human pathogen Архивная копия от 8 марта 2022 на Wayback Machine, March 12, 2021
74. ↑ 110 вопросов по эпидемиологии новой коронавирусной пневмонии, 2020.3, с. 32.
75. ↑ Ученые выяснили оптимальную температуру для передачи коронавируса//Известия 12 марта 2020, 20:16 (неопр.). Дата обращения: 30 марта 2020. Архивировано 19 марта 2020 года.
76. ↑ Perera, Mahen R.A.; Chan, Michael C.W.; Yen, Hui-Ling; Chu, Julie T.S.; Chin, Alex W.H.; Peiris, Malik; Hui, Kenrie P.Y.; Poon, Leo L.M. Stability of SARS-CoV-2 in different environmental conditions (неопр.) (2020). doi:10.1101/2020.03.15.20036673. Дата обращения: 30 марта 2020. Архивировано 17 апреля 2020 года.
77. ↑ Названа температура, при которой активизируется коронавирус (РИА Новостей, 29.03.2020 9:48) (неопр.). Дата обращения: 30 марта 2020. Архивировано 31 марта 2020 года.
78. ↑ Coronavirus Can Survive In The Air For Several Hours And On Surfaces For Three Days, Study Suggests (неопр.) (12 марта 2020). Дата обращения: 30 марта 2020. Архивировано 6 апреля 2020 года.

## Литература

[править | править код]

* Маджидов Т. И., Куракин Г. Ф. Компьютерные технологии против коронавируса: первые результаты // Природа. — 2020. — № 3. — С. 3—15. — doi:10.7868/S0032874X20030011.
* Якутенко И. И. Вирус, который сломал планету: почему SARS-CoV-2 такой особенный и что нам с ним делать. — М.: Альпина Нон-фикшн, 2021. — 399 с. — ISBN 978-5-00139-382-5.
* Wu, F. Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome : GenBank MN908947.3 :  [англ.] / F. Wu, Zhao,S., Yu,B. … [et al.] // GenBank : journal. — Bethesda, MD, 2020. — 12 January.
* Ji, W. Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross‐species transmission from snake to human :  [англ.] / W. Ji, W. Wang, X. Zhao … [et al.] // Journal of Medical Virology[англ.]. — Hoboken, New Jersey : Wiley-Blackwell[англ.], 2020. — 22 January. — P. 1—29. — ISSN 1096-9071. — doi:10.1002/jmv.25682. — PMID 31967321.
* Callaway, E. Why snakes probably aren’t spreading the new China virus : One genetic analysis suggests reptilian reservoir — but researchers doubt that the coronavirus could have originated in animals other than birds or mammals :  [англ.] / E. Callaway, D. Cyranoski // Nature : журн. — Nature Publishing Group, 2020. — 23 January. — doi:10.1038/d41586-020-00180-8.
* Zhou, Peng. Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin : [preprint] :  [англ.] / Peng Zhou, Xing-Lou Yang, Xian-Guang Wang … [et al.] // bioRxiv : [сайт]. — 2020. — 23 January. — 18 p. — doi:10.1101/2020.01.22.914952.
* 新型冠状病毒肺炎流行病学知识110问（110 вопросов из области знаний по эпидемиологии новой коронавирусной пневмонии) (кит.) / 刘民，刘霞，梁万年 主编 （гл. ред. Лю Минь, Лю Ся, Лян Ваньнянь). — 北京: 北京大学医学出版社 （издательство Пекинского медицинского университета), 2020.3. — 78 с. — ISBN 978-7-5659-2167-4.

## Ссылки

[править | править код]

* Geographical distribution of 2019-nCov cases globally. — European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC). (Актуальная информация по глобальному распространению вируса, включая распределение по миру, количество заболевший и смертей.)
* Coronavirus. — World Health Organisation. — Дата обращения: 26.01.2020. (Общая информация о коронавирусах от ВОЗ.)
* Novel Coronavirus 2019 Situation Summary, Wuhan, China (недоступная ссылка — история). — Centers For Disease Control and Prevention (CDC), 2020. — 25 January. — Дата обращения: 26.01.2020. (Общая информация о 2019-nCoV по данным Центров по контролю и профилактике заболеваний США.)
* Outbreak of acute respiratory syndrome associated with a novel coronavirus, China; First cases imported in the EU/EEA; second update. — European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC), 2020. — 26 January. (Обобщение данных по вирусу от Европейского центра профилактики и контроля заболеваний.)
* Risk assessment: Outbreak of acute respiratory syndrome associated with a novel coronavirus, China: first local transmission in the EU/EEA − third update. — European Centre for Disease Prevention and Control (ECDC), 2020. — 31 January. (Обобщение данных по вирусу от Европейского центра профилактики и контроля заболеваний.)
* Novel Coronavirus (2019-nCoV). — World Health Organisation. — Дата обращения: 26.01.2020. (Информация о вирусе 2019-nCoV от ВОЗ.)
* Novel Coronavirus (2019-nCoV) advice for the public. — World Health Organisation. — Дата обращения: 26.01.2020. (Рекомендации ВОЗ по профилактике нового коронавируса.)
* Genomic epidemiology of novel coronavirus (nCoV) // Real-time tracking of pathogen evolution. — Nextstrain. (Система отслеживания эволюции вируса в реальном времени.)
* Wuhan Coronavirus (2019-nCoV) Global Cases (by JHU CSSE) (англ.). Johns Hopkins University of Medicine. — Карта зарегистрированных случаев инфицирования 2019-nCoV на сайте Университета Джонса Хопкинса. Дата обращения: 27 января 2020. Архивировано 30 октября 2020 года.

Ссылки на внешние ресурсы

Словари и энциклопедии

* Большая китайская

Таксономия|

* EOL
* NCBI

В библиографических каталогах|

* BNE: XX6068537
* BNF: 17874459p
* GND: 1206288906
* NKC: ph1075646

COVID-19

Инфекция|

* Заболевание COVID-19
* профилактика
* вирус SARS-CoV-2
* происхождение[англ.]

Варианты|

* Кластер 5
* Альфа
* Бета
* Гамма
* Дельта
* Эпсилон[англ.]
* Дзета[англ.]
* Эта[англ.]
* Тета[англ.]
* Йота[англ.]
* Каппа[англ.]
* Лямбда[англ.]
* Мю[англ.]
* Омикрон

Вакцины
против COVID-19|

* Коваксин
* КовиВак
* Конвасэл
* Конвидеция
* Спутник V
* Спутник Лайт
* ЭпиВакКорона
* ЭпиВакКорона-Н
* Abdala
* AstraZeneca
* BBIBP-CorV
* Codagenix
* CoronaVac
* COVIran Barakat
* CureVac
* Inovio
* Johnson & Johnson
* Medigen MVC[англ.]
* Moderna
* Novavax
* Pfizer/BioNTech
* SCB-2019
* Valneva
* WIBP-CorV
* QazVac
* Zifivax

Некоторые внешние ссылки в этой статье ведут на сайты, занесённые в спам-лист.

Эти сайты могут нарушать авторские права, быть признаны неавторитетными источниками или по другим причинам быть запрещены в Википедии. Редакторам следует заменить такие ссылки ссылками на соответствующие правилам сайты или библиографическими ссылками на печатные источники либо удалить их (возможно, вместе с подтверждаемым ими содержимым).

Список проблемных ссылок

* eadaily.com/ru/news/2020/06/16/biologi-ssha-covid-19-bystro-mutiruet-skorost-zarazheniya-vyrosla-do-8-raz

|

*[et al.]: и другие: Ben Hu, Lei Zhang, Wei Zhang, Hao-Rui Si, Yan Zhu, Bei Li, Chao-Lin Huang, Hui-Dong Chen, Jing Chen, Yun Luo, Hua Guo, Ren-Di Jiang, Mei-Qin Liu, Ying Chen, Xu-Rui Shen, Xi Wang, Xiao-Shuang Zheng, Kai Zhao, Quan-Jiao Chen, Fei Deng, Lin-Lin Liu, Bing Yan, Fa-Xian Zhan, Yan-Yi Wang, Gengfu Xiao, Zheng-Li Shi
*[М.]: Москва