SIP1

| Доступные структуры

PDB| Поиск ортологов: PDBe RCSB
| Список идентификаторов PDB

2LEH, 3S6N

Идентификаторы
Псевдонимы| GEMIN2, SIP1, SIP1-delta, Survival of motor neuron protein-interacting protein 1, gem nuclear organelle associated protein 2
Внешние ID| OMIM: 602595 MGI: 1913853 HomoloGene: 37827 GeneCards: GEMIN2
| Расположение гена (человек)

Хр.| 14-я хромосома человека[1]

Локус| 14q21.1| Начало| 39,114,285 bp[1]
Конец| 39,136,973 bp[1]
| Расположение гена (Мышь)

Хр.| 12-я хромосома мыши[2]

Локус| 12|12 C1| Начало| 59,060,179 bp[2]
Конец| 59,075,256 bp[2]
| Паттерн экспрессии РНК

Bgee| | Человек| Мышь (ортолог)

|

| Наибольшая экспрессия в

* buccal mucosa cell

* secondary oocyte

* ventricular zone

* right testis

* left testis

| Наибольшая экспрессия в

* otic placode

* endocardial cushion

* primitive streak

* Vesicula otica

Дополнительные справочные данные
BioGPS| |

Дополнительные справочные данные
| Генная онтология

Молекулярная функция|

* связывание с белками плазмы

Компонент клетки|

* SMN complex
* SMN-Sm protein complex
* цитозоль
* spliceosomal complex
* ядрышко
* внутренний компонент клетки
* клеточное ядро
* нуклеоплазма
* цитоплазма
* ядерные тельца
* gemini of coiled bodies

Биологический процесс|

* RNA splicing, via transesterification reactions
* mRNA processing
* spliceosomal complex assembly
* Сплайсинг
* spliceosomal snRNP assembly
* import into nucleus

Источники: Amigo, QuickGO
| Ортологи

Вид| Человек| Мышь
Entrez| |

8487

66603

Ensembl| |

ENSG00000092208

ENSMUSG00000060121

UniProt| |

O14893

Q9CQQ4

RefSeq (мРНК)| |

NM_001009182
NM_001009183
NM_003616

NM_025656

RefSeq (белок)| |

NP_001009182
NP_001009183
NP_003607

NP_079932

Локус (UCSC)| Chr 14: 39.11 – 39.14 Mb| Chr 12: 59.06 – 59.08 Mb
Поиск по PubMed| Искать[3]| Искать[4]
Информация в Викиданных
| Смотреть (человек)| Смотреть (мышь)

|

Белок связанный с белком выживания моторных нейронов 1 (англ. Survival of motor neuron protein-interacting protein 1) — белок, который у людей кодируется геном SIP1[5][6][7].

## Взаимодействия

[править | править код]

Как было показано белок SIP1 взаимодействует с DDX20[8][9] и SMN1[6][10][11].

## См. также

[править | править код]

* Выживание моторных нейронов
* SMN1

## Примечания

[править | править код]

1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000092208 \- Ensembl, May 2017
2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000060121 \- Ensembl, May 2017
3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. ↑ Fischer U., Liu Q., Dreyfuss G. The SMN-SIP1 complex has an essential role in spliceosomal snRNP biogenesis (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — October (vol. 90, no. 6). — P. 1023—1029. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80368-2. — PMID 9323130.
6. ↑ 1 2 Liu Q., Fischer U., Wang F., Dreyfuss G. The spinal muscular atrophy disease gene product, SMN, and its associated protein SIP1 are in a complex with spliceosomal snRNP proteins (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 1997. — October (vol. 90, no. 6). — P. 1013—1021. — doi:10.1016/S0092-8674(00)80367-0. — PMID 9323129.
7. ↑ Entrez Gene: SIP1 survival of motor neuron protein interacting protein 1  (неопр.).
8. ↑ Mourelatos, Zissimos; Dostie Josée; Paushkin Sergey; Sharma Anup; Charroux Bernard; Abel Linda; Rappsilber Juri; Mann Matthias; Dreyfuss Gideon. miRNPs: a novel class of ribonucleoproteins containing numerous microRNAs (англ.) // Genes Dev. : journal. — United States, 2002. — March (vol. 16, no. 6). — P. 720—728. — ISSN 0890-9369. — doi:10.1101/gad.974702. — PMID 11914277. — PMC 155365.
9. ↑ Charroux B Pellizzoni L Perkinson R A Shevchenko A Mann M Dreyfuss G. Gemin3: A Novel Dead Box Protein That Interacts with Smn, the Spinal Muscular Atrophy Gene Product, and Is a Component of Gems (англ.) // J. Cell Biol.[англ.] : journal. — UNITED STATES, 1999. — December (vol. 147, no. 6). — P. 1181—1194. — ISSN 0021-9525. — doi:10.1083/jcb.147.6.1181. — PMID 10601333. — PMC 2168095.
10. ↑ Carnegie Graeme K Sleeman Judith E Morrice Nick Hastie C James Peggie Mark W Philp Amanda Lamond Angus I Cohen Patricia T W. Protein phosphatase 4 interacts with the Survival of motor neurons complex and enhances the temporal localisation of snRNPs (англ.) // Journal of Cell Science[англ.] : journal. — England: The Company of Biologists[англ.], 2003. — May (vol. 116, no. Pt 10). — P. 1905—1913. — ISSN 0021-9533. — doi:10.1242/jcs.00409. — PMID 12668731.
11. ↑ Meister, G; Bühler D Laggerbauer B Zobawa M Lottspeich F Fischer U. Characterization of a nuclear 20S complex containing the survival of motor neurons (SMN) protein and a specific subset of spliceosomal Sm proteins (англ.) // Human Molecular Genetics[англ.] : journal. — ENGLAND: Oxford University Press, 2000. — August (vol. 9, no. 13). — P. 1977—1986. — ISSN 0964-6906. — doi:10.1093/hmg/9.13.1977. — PMID 10942426.

Клеточное ядро

Ядерная мембрана/
Ядерная ламина|

* Ядерные поры: Нуклеопорины
* NUP35[англ.]
* NUP37[англ.]
* NUP43[англ.]
* NUP50[англ.]
* NUP54[англ.]
* NUP62[англ.]
* NUP85[англ.]
* NUP88[англ.]
* NUP93[англ.]
* NUP98[англ.]
* NUP107[англ.]
* NUP133[англ.]
* NUP153[англ.]
* NUP155[англ.]
* NUP160
* NUP188[англ.]
* NUP205[англ.]
* NUP210[англ.]
* NUP214[англ.]
* AAAS

Ядрышко|

* Околоядрышковый компартмент
* PTBP1[англ.]
* CUGBP1[англ.]
* TCOF[англ.]
* Атаксин 7

Прочее|

| PML-тельца|

* Параспеклы
* Тельце Кахаля
* GEMIN4[англ.]
* GEMIN5[англ.]
* GEMIN6[англ.]
* GEMIN7[англ.]
* GEMIN8[англ.]
* SMN[англ.]/SIP1
* коилин

|

SMC-белки|

* Когезин
* SMC1A[англ.]
* SMC1B
* SMC3
* Конденсин
* NCAPD2
* NCAPD3
* NCAPG
* NCAPG2
* NCAPH[англ.]
* NCAPH2
* SMC2
* SMC4
* Репарация ДНК
* SMC5
* SMC6

Переходные
ядерные белки|

* TNP1
* TNP2

* Хроматин
* Ядерный матрикс
* Нуклеоплазма
* Нуклеозоль