Dicer

DICER酶

| 已知的結構

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2EB1、​4NGB、​4NGC、​4NGD、​4NGF、​4NGG、​4NH3、​4NH5、​4NH6、​4NHA、​4WYQ

識別號
别名| DICER1；, DCR1, Dicer, Dicer1e, HERNA, MNG1, RMSE2, K12H4.8-LIKE, dicer 1, ribonuclease III, GLOW
外部ID| OMIM：606241 MGI：2177178 HomoloGene：13251 GeneCards：DICER1
相關疾病
胸膜肺母細胞瘤、​胚胎性横纹肌肉瘤、​DICER1 syndrome、​familial multinodular goiter[1]
| 基因位置（人类）

染色体| 14號染色體[2]

基因座| 14q32.13| 起始| 95,086,228 bp[2]
终止| 95,158,010 bp[2]
| 基因位置（小鼠）

染色体| 小鼠12号染色体[3]

基因座| 12 E|12 54.83 cM| 起始| 104,654,001 bp[3]
终止| 104,718,211 bp[3]
| 基因本體

分子功能| • 核苷酸結合
• helicase activity
• protein domain specific binding
• pre-miRNA binding
• 金屬離子結合
• endoribonuclease activity
• endoribonuclease activity, producing 5'-phosphomonoesters
• 血浆蛋白结合
• siRNA binding
• RNA binding
• nuclease activity
• double-stranded RNA binding
• endonuclease activity
• 水解酶活性
• ATP結合
• ribonuclease III activity
• DNA结合
• deoxyribonuclease I activity

細胞組分| • 細胞質
• 细胞质基质
• RNA誘導沉默複合體
• 生长锥
• ARC complex
• RISC-loading complex
• 轴突
• 树突
• 细胞核
• endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment
• 外排體

生物學過程| • neuron projection morphogenesis
• RNA processing
• negative regulation of transcription by RNA polymerase II
• peripheral nervous system myelin formation
• pre-miRNA processing
• positive regulation of myelination
• nerve development
• RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic
• positive regulation of Schwann cell differentiation
• negative regulation of Schwann cell proliferation
• production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA
• miRNA metabolic process
• production of siRNA involved in RNA interference
• 基因沉默
• apoptotic DNA fragmentation
• 腫瘤壞死因子產生的負調控
• NIK/NF-kappaB signaling
• negative regulation of gene expression
• tube formation

Sources:Amigo / QuickGO
直系同源
物種| 人類| 小鼠
Entrez| |

23405

192119

Ensembl| |

ENSG00000100697

ENSMUSG00000041415

UniProt| |

Q9UPY3

Q8R418,F8VQ54

mRNA​序列| |

​NM_001195573
​NM_001271282
​NM_001291628
​NM_030621
​NM_177438

NM_148948

蛋白序列| |

NP_001182502
​NP_001258211
​NP_001278557
​NP_085124
​NP_803187

NP_683750

基因位置​（UCSC）| Chr 14: 95.09 – 95.16 Mb| Chr 12: 104.65 – 104.72 Mb
PubMed​查找| [4]| [5]
維基數據
| 檢視/編輯人類| 檢視/編輯小鼠

|

Dicer蛋白在人體內由DICER1基因編碼，是一種在RNA干擾中扮演着重要角色的RNA酶，屬於III型RNA酶。在RNA誘導沉默複合體（RISC）的激活中，Dicer扮演着核心角色。在RNA干擾過程中，Dicer可以將shRNA（小髮卡RNA）切割、加工爲siRNA（小干擾RNA），將miRNA前體加工爲miRNA（微RNA）。

## 功能

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Dicer酶的作用是將shRNA剪切爲siRNA或將miRNA前體剪切爲miRNA

Dicer酶會將轉錄而成的、經Drosha酶初步處理的shRNA（小髮卡RNA）剪切爲siRNA，或將miRNA前體（pre-miRNA）剪切爲miRNA。隨後，siRNA或miRNA會激活RISC的組裝和功能的行使，使RNA干擾得以繼續進行[6]。

## 結構

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肠贾第鞭毛虫（Giardia intestinalis）體內的Dicer蛋白。III型RNA酶結構域以綠色標出，PAZ以黃色標出，平臺結構域以紅色標出，連接不同結構域的螺旋以藍色標出[7]

人DICER蛋白屬於III型RNA酶，具有解旋酶活性以及PAZ結構域（Piwi（英语：Piwi）/Argonaute/Zwille）[8][9]。除了上述結構域外，DICER蛋白還有兩個RNaseIII結構域和兩個雙鏈RNA結合結構域（DUF283和dsRBD）[10]。

目前的研究表明PAZ結構域可以和shRNA（小髮卡RNA）3'端兩個凸出的核苷酸結合，III型RNA酶結構域則會在dsRNA周圍形成一個假二聚體，啓動核酸鏈的剪切，使shRNA長度逐漸縮短。PAZ結構域和III型RNA酶結構域之間的距離由連接他們的螺旋結構決定，會影響到產生的miRNA/siRNA長度[7]。Dicer的dsRBD結構域會與shRNA結合，不過目前並未解析出具體的結合位點。推測認爲dsRBD區可能會與一些調節蛋白（比如人體內的TRBP，果蠅體內的R2D2、Loqs）結合形成複合體，調控RNA酶活性，進而調節終產物的產生[11]。有推測認爲解旋酶結構域會參與對長底物的處理[11]

## 參見

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* RNA干擾
* RNA誘導沉默複合體

## 參考

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1. ^ 與DICER酶相關的疾病；在維基數據上查看/編輯參考.
2. ^ 2.0 2.1 2.2 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000100697 \- Ensembl, May 2017
3. ^ 3.0 3.1 3.2 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000041415 \- Ensembl, May 2017
4. ^ Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
5. ^ Mouse PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
6. ^ Bernstein E, Caudy A, Hammond S, Hannon G. Role for a bidentate ribonuclease in the initiation step of RNA interference. Nature. 2001, 409 (6818): 363–6. PMID 11201747. doi:10.1038/35053110.
7. ^ 7.0 7.1 Macrae IJ, Zhou K, Li F, Repic A, Brooks AN, Cande WZ, Adams PD, Doudna JA. Structural basis for double-stranded RNA processing by Dicer. Science. Jan 2006, 311 (5758): 195–8. PMID 16410517. doi:10.1126/science.1121638.
8. ^ Entrez Gene: DICER1 Dicer1, Dcr-1 homolog (Drosophila). （原始内容存档于2019-09-24）.
9. ^ Matsuda S, Ichigotani Y, Okuda T, Irimura T, Nakatsugawa S, Hamaguchi M. Molecular cloning and characterization of a novel human gene (HERNA) which encodes a putative RNA-helicase. Biochimica et Biophysica Acta. Jan 2000, 1490 (1-2): 163–9. PMID 10786632. doi:10.1016/S0167-4781(99)00221-3.
10. ^ Hammond SM. Dicing and slicing: the core machinery of the RNA interference pathway. FEBS Letters. Oct 2005, 579 (26): 5822–9. PMID 16214139. doi:10.1016/j.febslet.2005.08.079.
11. ^ 11.0 11.1 Cenik ES, Fukunaga R, Lu G, Dutcher R, Wang Y, Tanaka Hall TM, Zamore PD. Phosphate and R2D2 restrict the substrate specificity of Dicer-2, an ATP-driven ribonuclease. Molecular Cell. Apr 2011, 42 (2): 172–84. PMC 3115569 . PMID 21419681. doi:10.1016/j.molcel.2011.03.002.