Micromonosporaceae
Topic: Biology
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| Micromonosporaceae | |
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| File:Actinoplanes utahensis NRRL B-16727 (Type Strain).jpg | |
| Actinoplanes utahensis on agar plate | |
Scientific classification 
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| Domain: | Bacteria |
| Phylum: | Actinomycetota |
| Class: | Actinomycetia |
| Order: | Micromonosporales Genilloud 2015[1] |
| Family: | Micromonosporaceae Krasil'nikov 1938 (Approved Lists 1980) |
| Type genus | |
| Micromonospora Ørskov 1923 (Approved Lists 1980)
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| Genera | |
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See text. | |
| Synonyms | |
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Synonyms of Micromonosporales
Synonyms of Micromonosporaceae
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Micromonosporaceae is a family of bacteria of the class Actinomycetia. They are gram-positive, spore-forming soil organisms that form a true mycelium.
Phylogeny
The currently accepted taxonomy is based on the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[2] and National Center for Biotechnology Information (NCBI).[3]
| Whole-genome based phylogeny[4][lower-alpha 1] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 16S rRNA based LTP_08_2023[5][6][7] | 120 marker proteins based GTDB 08-RS214[8][9][10] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Genera incertae sedis:
- "Solwaraspora" Magarvey et al. 2004[11]
Notes
- ↑ Actinorhabdospora, Allocatelliglobosispora, Allorhizocola, Catellatospora, Couchioplanes, Krasilnikovia, Luedemannella, Mangrovihabitans, Phytohabitans, Phytomonospora, Pilimelia, Planosporangium, Plantactinospora, Polymorphospora, Rhizocola, Rugosimonospora, Spirilliplanes, and Virgisporangium are not included in this phylogenetic tree.
See also
References
- ↑ "Order XI Micromonosporales ord. nov.". Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. 5 (2nd ed.). New York: Springer. 2012. p. 1035.
- ↑ "Micromonosporaceae". https://lpsn.dsmz.de/family/micromonosporaceae.
- ↑ Sayers. "Micromonosporales". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Tree&id=85008&lvl=3&lin=f&keep=1&srchmode=1&unlock.
- ↑ "Genome-Based Taxonomic Classification of the Phylum Actinobacteria". Front. Microbiol. 9: 2007. 2018. doi:10.3389/fmicb.2018.02007. PMID 30186281.
- ↑ "The LTP". https://imedea.uib-csic.es/mmg/ltp/#LTP.
- ↑ "LTP_all tree in newick format". https://imedea.uib-csic.es/mmg/ltp/wp-content/uploads/ltp/LTP_all_08_2023.ntree.
- ↑ "LTP_08_2023 Release Notes". https://imedea.uib-csic.es/mmg/ltp/wp-content/uploads/ltp/LTP_08_2023_release_notes.pdf.
- ↑ "GTDB release 08-RS214". https://gtdb.ecogenomic.org/about#4%7C.
- ↑ "bac120_r214.sp_label". https://data.gtdb.ecogenomic.org/releases/release214/214.0/auxillary_files/bac120_r214.sp_labels.tree.
- ↑ "Taxon History". https://gtdb.ecogenomic.org/taxon_history/.
- ↑ "Isolation and Characterization of Novel Marine-Derived Actinomycete Taxa Rich in Bioactive Metabolites". Applied and Environmental Microbiology 70 (12): 7520–7529. 2004. doi:10.1128/AEM.70.12.7520-7529.2004. PMID 15574955. Bibcode: 2004ApEnM..70.7520M.
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