Neomura

Neomura
Taxonomía
(sin rango)	Biota
(sin rango):	Cytota
(sin rango):	Neomura
Dominios
Archaea Eukarya
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Neomura es el clado que incluye las arqueas y los eucariota. Según Thomas Cavalier-Smith,^[1]​ la distinción entre Neomura y Bacteria fue marcada por veinte adaptaciones evolutivas, que acompañaron o derivaron de otras dos adaptaciones importantes: el desarrollo de histonas para reemplazar la ADN girasa y la pérdida de la pared celular de peptidoglucano que es substituida por otra de glicoproteína. La palabra "Neomura" refleja este último cambio: significa "paredes nuevas".

Por consiguiente, Archaea y Eukarya serían grupos hermanos o bien según una versión revisada actual las arqueas serían ancestros de Eukarya, pero las arqueas se adaptaron a ambientes calientes y ácidos, reemplazando los lípidos acilo éster de las bacterias por lípidos prenil éter, y usando las glicoproteínas como una nueva pared rígida (exoesqueleto), y por tanto, retuvieron la organización celular bacteriana. Los eucariontes, en cambio, usaron la nueva superficie de proteínas como una capa flexible que dio lugar a la fagocitosis y que llevó, en última instancia, al cambio en la estructura de la célula.^[2]​

Neomura es un grupo muy variado, que comprende desde procariontes extremófilos hasta los eucariontes pluricelulares, pero todos ellos comparten ciertas características moleculares. Todos tienen histonas que se utilizan como andamiaje de los cromosomas y la mayoría presentan intrones. Todos usan la molécula de metionina como iniciador de aminoácidos para la síntesis de proteínas (las bacterias usan formilmetionina).

Cuando Carl Woese introdujo por primera vez su sistema de tres dominios en 1990, se creía que los tres dominios, Bacteria, Archaea y Eukarya, eran igualmente antiguos e igualmente relacionados en el árbol de la vida. Algunas pruebas comenzaron a sugerir que Eukarya y Archaea estaban más estrechamente relacionados entre sí que con las bacterias. Estas pruebas incluyen el uso de colesteroles y proteasomas, moléculas complejas que no se encuentran en la mayoría de las bacterias. Así, se pensó que había dos ramas de la vida: Bacteria y Neomura.^[3]​

Cavalier-Smith en 2002 propuso que el clado de las arqueas y eucariotas se puede denominar Neomura.^[4]​

Sin embargo, muchos análisis filogenéticos posteriores respaldaron un sistema de dos dominios en el que los eucariotas se originaron dentro de las arqueas, este escenario había sido propuesto por James A. Lake en 1984 y fue fuertemente respaldado por el descubrimiento de las arqueas Asgard o Promethearchaeota sugiriendo que los eucariotas se originaron de una arquea Asgard mediante la endosimbiosis con una alfaproteobacteria. La mayoría de los análisis filogenéticos dan el siguiente resultado:^[5]​^[6]​

Cavalier-Smith en análisis filogenéticos de 2002 y 2006 encontró que Neomura se ramifica dentro del dominio bacteriano como grupo hermano de Actinomycetota por lo que no hay una organización en dominios y que Chloroflexota es el taxón más basal de los organismos celulares lo que implica que el último antepasado común universal (LUCA) era fotosíntetico. Sin embargo, en este análisis Eukaryota era grupo hermano de Archaea y no un subclado como en el sistema de dos dominios.^[7]​

Sin embargo, en 2020 Cavalier-Smith en un análisis de múltiples proteínas ribosómicas ha encontrado soporte para su hipótesis con Cloroflexota como el clado más basal de Cytota y las bacterias siendo parafiléticas de Neomura, pero este árbol difería del anterior en que el grupo hermano de Neomura era Planctobacteria no Actinomycetota, y las arqueas eran parafiléticas de los eucariotas como lo sugirieron los otros análisis moleculares. Por lo que ahora una versión revisada reconoce el origen de los eucariotas dentro de Archaea y propone que el ancestro más probable de este grupo sea una planctobacteria y no una actinobacteria como se propuso anteriormente.^[8]​ Otros análisis filogenéticos también obtuvieron apoyo para esta ramificación. No obstante, no es respaldada por la mayoría de los estudios que en cambio apoyan más el árbol de dos dominios.^[9]​

El árbol filogenético sería aproximadamente el siguiente:^[8]​^[9]​

• Eucariogénesis