Wanner étudie les mathématiques à l'Université d'Innsbruck où il obtient un doctorat en 1965 sous la direction de Wolfgang Gröbner[3] (titre de la thèse : « Ein Beitrag zur numerischen Behandlung von Randwertproblemen gewöhnlicher Differentialgleichungen »[4]. Il travaille à Innsbruck et depuis 1973 à l'Université de Genève, où il est professeur honoraire.
Wanner travaille en analyse numérique, notamment dans le domaine des équations différentielles ordinaires. Il a écrit, avec Ernst Hairer une monographie en deux volumes sur ce sujet; il est aussi auteur d'un livre d'enseignement de l'analyse, traduit en français sous le titre : Analyse au fil de l'histoire et d'un livre de géométrie qui utilisent une approche historique.
[HW] Ernst Hairer et Gerhard Wanner, Analysis in der historischen Entwicklung, Springer, , 405 p. (ISBN978-3-642-13766-2). — Paru auparavant en anglais chez Springer : Analysis by Its History. (2008). Traduction française :
[OW] Alexander Ostermann et Gerhard Wanner, Geometry by Its History, Springer, , 440 p. (ISBN978-3-642-29162-3).
[HLW] Ernst Hairer, Christian Lubich et Gerhard Wanner, Geometric Numerical Integration : Structure-Preserving Algorithms for Ordinary Differential Equations, Springer, , 2e éd., 644 p. (ISBN978-3-642-05157-9).
[HNW-I] Ernst Hairer, Sylvert Nørsett et Gerhard Wanner, Solving Ordinary Differential Equations I, Springer, (ISBN978-3-642-05163-0).
[HNW-II] Ernst Hairer, Sylvert Nørsett et Gerhard Wanner, Solving Ordinary Differential Equations II : Stiff and Differential-Algebraic Problems, Springer, , 2e éd., 614 p. (ISBN978-3-642-05220-0).
↑Les bases de Gröbner portent bien son nom, mais ont été développées en réalité en 1965 dans la thèse de doctorat de son élève Bruno Buchberger. C'est lui qui les nomme ainsi d'après son directeur de thèse.